Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg4dQ8BGV9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms