Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp4f39Q8BGU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms