Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trmt12Q8BG71 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms