Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms