Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG26

Rusc1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc1Q8BG26 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rusc1Q8BG26 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rusc1Q8BG26 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms