Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp4Q8BFV3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms