Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc172Q810N9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc172Q810N9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms