Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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