Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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