Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NanogQ80Z64 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms