Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed4Q80WQ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed4Q80WQ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms