Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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