Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup214Q80U93 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms