Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pja2Q80U04 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms