Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf7ipQ7TT18 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf7ipQ7TT18 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms