Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnf1Q7TSH7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms