Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4b1Q7TS58 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms