Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mycbp2Q7TPH6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms