Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sbno2Q7TNB8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms