Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf139Q7TMV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf139Q7TMV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms