Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmed3Q78IS1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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