Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mindy1Q76LS9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms