Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms