Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp34Q6ZQ93 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp34Q6ZQ93 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms