Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NinlQ6ZQ12 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms