Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot1Q6ZQ08 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms