Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorQ6ZPI3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms