Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms