Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ift172Q6VH22 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift172Q6VH22 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms