Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc57Q6PHN1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms