Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms