Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a7Q6PGE7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms