Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmeff1Q6PFE7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms