Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms