Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms