Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms