Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbtb40Q6PCS8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms