Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp49Q6P9L4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms