Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx6Q6P8X1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx6Q6P8X1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms