Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc148Q6P5U8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc148Q6P5U8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms