Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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