Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Podnl1Q6P3Y9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms