Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frg2f1Q6P3A2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms