Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nsd3Q6P2L6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsd3Q6P2L6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms