Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtl3Q6P1Y1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms