Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms