Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnajc8Q6NZB0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc8Q6NZB0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms