Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms