Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rcbtb1Q6NXM2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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