Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms